Cytydyno-5′-difosfocholina, w postaci soli wewnętrznej zdefiniowanej w prawie europejskim, dostarczana do potwierdzania tożsamości, badania zanieczyszczeń i opracowywania metod. Wyłącznie odczynnik laboratoryjny i wzorzec analityczny — nie do spożycia przez ludzi ani zwierzęta i nie jest produktem leczniczym, mimo że ta cząsteczka jest substancją czynną dopuszczonych leków w innych krajach.
Katalog nie podaje wartości czystości dla tej substancji, ponieważ wartość czystości bez określonej podstawy nie jest specyfikacją: dokumentacja partii podaje zawartość, metodę, podstawę i zawartość wody. Poniżej przedstawiono pełne dane rejestrowe, pułapki tożsamości związane z solą i rekordem, lukę widmową fosforu, punkty wyjścia dla opracowywania metod, pełną specyfikację prawną oraz 47 cytowanych źródeł.
Koszt wysyłki jest naliczany raz na zamówienie, a nie za każdy produkt - dodanie kolejnych pozycji do tego samego zamówienia nie zwiększa kosztu dostawy.
Klasyfikacja produktu — przeczytaj przed złożeniem zamówienia. Ten produkt to odczynnik chemiczny i wzorzec analityczny. Brzmi ono: nie jest produktem leczniczym, suplementem diety, żywnością, paszą, nową żywnością ani kosmetykiem i nie jest przeznaczony do spożycia przez ludzi ani zwierzęta ani do jakiegokolwiek podawania in vivo. Jest dostarczany wyłącznie laboratoriom, instytucjom badawczym i użytkownikom profesjonalnym do prac analitycznych, chromatograficznych i prac nad opracowaniem metod in vitro. Podsumowane na tej stronie wyniki badań naukowych opisują substancje badane w opublikowanych pracach laboratoryjnych i klinicznych; przedstawiono je tutaj jako fakty bibliograficzne dotyczące tej literatury i nie stanowią deklaracji dotyczących produktu, wskazówek dawkowania ani zalecenia jakiegokolwiek zastosowania tego odczynnika.
Dwa atomy fosforu i ani jednego publicznego widma fosforu. Przed złożeniem zamówienia należy zapoznać się z sekcjami 5, 7 i 9. Cytykolina zawiera mostek difosforanowy — 12,69% jego masy stanowi fosfor — a fosfor-31 jest jedynym jądrem, które bezpośrednio informuje, czy ten mostek jest nienaruszony. Publiczny rekord związku nie zawiera widma 31P, widma 1H, widma 13C ani danych z zakresu podczerwieni, spektroskopii ramanowskiej i ultrafioletu [1]. Zawiera dane spektrometrii mas i nic więcej. Jednocześnie cząsteczka ma obliczoną wartość logP wynoszącą −4 i powierzchnię polarną wynoszącą 214 Å2 [1], więc na konwencjonalnej kolumnie z odwróconą fazą eluuje w objętości martwej razem z własnymi produktami hydrolizy — dokładnie tymi zanieczyszczeniami, które prawo europejskie wymienia z nazwy i limituje liczbowo [5]. Ta strona wyjaśnia, co to oznacza dla każdego, kto musi udowodnić, jaka cząsteczka znajduje się w fiolce.
RZZPDXZPRHQOCG-OJAKKHQRSA-N. Drugi rekord ma ten sam pierwszy blok i kończy się -UHFFFAOYSA-N — sekcja 3Ta strona opisuje cytykolinę dostarczaną jako wzorzec analityczny: odważona ilość pojedynczej zidentyfikowanej substancji, przeznaczona jako punkt odniesienia, względem którego mierzy się inną próbkę. Jest to odczynnik, według którego kalibruje się metodę, a nie artykuł do spożycia.
Cytykolina jest nukleotydem pirymidynowym. Zasada cytozynowa znajduje się na pierścieniu β-D-rybofuranozy; pozycja 5′ tego pierścienia zawiera mostek difosforanowy; a dalszy koniec tego mostka zawiera resztę choliny poprzez jej czwartorzędowy azot. Cząsteczka jest więc sama w sobie jonem obojnaczym — stały ładunek dodatni na czwartorzędowej grupie amoniowej, ładunek ujemny na fosforanie — dlatego zarówno rejestr, jak i prawo europejskie opisują sprzedawaną substancję jako wewnętrzna sól [1][5]. Biochemicznie jest to aktywowany produkt pośredni szlaku Kennedy’ego, etapu, w którym cholina zostaje przeznaczona do syntezy fosfatydylocholiny; rola ta została ustalona w 1957 [28] i jest przedstawiona w nowoczesnej literaturze przeglądowej [38].
Jest to również, nietypowo dla tego katalogu, związek o trzech jednoczesnych statusach regulacyjnych. Jest dopuszczonym lekiem w kilku krajach i posiada kod anatomiczno-terapeutyczno-chemiczny N06BX06 [8]. Jest dopuszczoną nową żywnością w Unii Europejskiej, z określoną specyfikacją, limitami ilościowymi i obowiązkowym oświadczeniem na etykiecie zapisanym w rozporządzeniu wykonawczym Komisji [5]. I nie ma żadnego pozwolenia na dopuszczenie do obrotu w Polsce [10]. Laboratorium, które napotyka tę substancję w próbce — laboratorium celne, zewnętrzna firma testująca, grupa uniwersytecka — identyfikuje zatem cząsteczkę, której status prawny zależy od tego, po której stronie granicy i w jakiej kategorii produktu się znajduje.
Dlaczego laboratorium potrzebuje uwierzytelnionego wzorca analitycznego tego konkretnego związku. Cztery niezależne powody, każdy zmierzony, a nie tylko stwierdzony, i każdy szczegółowo przedstawiony poniżej. Po pierwsze, nie ma zdeponowanego widma NMR żadnego jądra, a dla fosforu nie ma żadnego — jądra, które informuje o mostku difosforanowym (sekcja 9). Po drugie, substancja jest sprzedawana komercyjnie w dwóch formach, których masy molowe różnią się o 4,50%, więc forma musi być zadeklarowana, zanim jakiekolwiek liczenie moli ma sens, a ta strona deklaruje jedną (sekcja 3). Po trzecie, w chromatografii odwróconych faz, do której sięgają najpierw laboratoria, ten analit eluuje w objętości martwej obok dwóch zanieczyszczeń, które prawo europejskie ogranicza z nazwy (sekcje 5 i 7). Po czwarte, opublikowana literatura analityczna dotycząca samej substancji jest niemal pusta. Każda znaleziona przez nas opublikowana metoda, która oznacza ją chromatograficznie lub metodą spektroskopii optycznej, oznacza ją zmieszaną z piracetamem [19][21][22], a te trzy prace pochodzą tylko z dwóch laboratoriów — dwie z nich mają tych samych pięciu autorów w innej kolejności. Jedyna opublikowana próba biorównoważności oznaczyła ilościowo metabolit cholinę, a nie związek macierzysty [23].
Dwie sąsiednie karty w tym katalogu poruszają powiązane problemy i warto je przeczytać w kontekście tej. Alpha-GPC jest drugim dawcą choliny w tym katalogu i zawodzi w lustrzany sposób: ma izomer pozycyjny, którego spektrometria mas nie potrafi rozróżnić, ma opublikowaną i zwalidowaną ilościową metodę 31P NMR [26], ale nie ma zdeponowanego widma fosforu, z którym można by ją porównać. Cytykolina nie ma ani metody, ani widma. Chlorowodorek prokainy jest najwyraźniejszą w katalogu ilustracją drugiej połowy problemu — tego, że sól jest inną substancją niż zasada, z której powstała, ma inną masę molową, a ważenie ma sens dopiero wtedy, gdy określi się, którą z nich się ma.
Warunki dostawy tego i wszystkich pozostałych materiałów odniesienia zebrano w kategorii wzorców analitycznych.
| INN | Cytykolina; zapisana w rejestrze jako Citicoline [INN:JAN], gdzie JAN jest przyjętą nazwą japońską |
|---|---|
| Nazwy zwyczajowe | CDP-choline; cytidine 5′-diphosphocholine; cytidine diphosphate choline; citicolina; citicolinum |
| Numer rejestrowy CAS | 987-78-0 |
| Numer EC | 213-580-7 |
| PubChem CID | 13804 |
| UNII (FDA) | 536BQ2JVC7 |
| ChEBI | CHEBI:16436 |
| ChEMBL | CHEMBL1231700 |
| DrugBank / DrugCentral | DB12153, z odesłaniem również do DB04290 / 664 |
| KEGG | C00307 jako związek; D00057 jako lek, oznaczony zgodnie z japońskim spisem farmakopealnym |
| NCI Thesaurus | C96743 |
| DSSTox | DTXSID9048431 |
| Numer MDL | MFCD00868097 |
| Numer NSC | 122002 |
| Nikkaji | J55.713G |
| Wikidata | Q28529682 |
| ATC | N06BX06; weterynaryjny QN06BX06 [8] |
| Nazwy handlowe leków gdzie indziej | Somazina, Difosfocin, Recognan, Nicholin, Nicolin, Cidifos, Neucolis, Corenalin, Emicholin; Ceraxon to sól sodowa [1][2] |
| IUPAC (obliczone) | [[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate |
|---|---|
| Nazwa używana w prawie UE | Choliny cytydyno-5′-pirofosforan; cytydyno-5′-(triwodoro difosforan) P′-[2-(trimetyloamoniowy)etylu] ester wewnętrzna sól [5] |
| SMILES łącznościowy | C[N+](C)(C)CCOP(=O)([O-])OP(=O)(O)OCC1C(C(C(O1)N2C=CC(=NC2=O)N)O)O |
| SMILES izomeryczny | C[N+](C)(C)CCOP(=O)([O-])OP(=O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)N2C=CC(=NC2=O)N)O)O |
| InChI | InChI=1S/C14H26N4O11P2/c1-18(2,3)6-7-26-30(22,23)29-31(24,25)27-8-9-11(19)12(20)13(28-9)17-5-4-10(15)16-14(17)21/h4-5,9,11-13,19-20H,6-8H2,1-3H3,(H3-,15,16,21,22,23,24,25)/t9-,11-,12-,13-/m1/s1 |
| InChIKey | RZZPDXZPRHQOCG-OJAKKHQRSA-N |
| Obliczone deskryptory | XLogP3 −4 · TPSA 214 Å2 · donorów 4 · akceptorów 11 · wiązań rotowalnych 10 · atomów ciężkich 31 · złożoność 821 · formalny ładunek 0 · jednostek kowalencyjnie związanych 1 · atomów izotopowych 0 · kanoniczny |
Trzy wiersze w tej drugiej tabeli decydują o czymś praktycznym później i warto się nad nimi zatrzymać. Formalny ładunek wynosi zero, podczas gdy cząsteczka nosi dwa pełne ładunki — trwale kationowy czwartorzędowy atom azotu i anionowa grupa fosforanowa. To właśnie oznacza termin wewnętrzna sól , i dlatego pH fazy ruchomej jest tu znacznie słabszą dźwignią, niż podpowiada intuicja chemika (sekcja 6). XLogP3 −4 to wartość skrajna nawet wśród związków polarnych; lipofilowy koniec tego katalogu, bromantan, zajmuje przeciwny biegun i żadna pojedyncza metoda w odwróconym układzie faz nie obejmuje obu. Dziesięć wiązań obrotowych sprawia, że cząsteczka jest konformacyjnie giętka, co ma znaczenie zarówno dla danych dotyczących ruchliwości jonów w sekcji 8, jak i dla każdej próby przewidywania retencji na podstawie struktury.
Zanim przejdziemy do chemii, ewidencja — ponieważ w przypadku tej substancji pytanie o tożsamość nie brzmi co, ale która. Trzy odrębne problemy wiążą się z nazwą cytykolina, a każdy z nich może umieścić niewłaściwy numer na świadectwie analizy.
Cytykolina jest sprzedawana w dwóch formach, które są chemicznie różnymi substancjami o różnych wpisach rejestrowych, różnych numerach CAS i różnych masach.
| Właściwość | Sól wewnętrzna (wolny kwas, jon obojnaczy) | Sól sodowa |
|---|---|---|
| CAS | 987-78-0 | 33818-15-4 |
| PubChem CID | 13804 | 36605 |
| Numer EC | 213-580-7 | 251-689-1 |
| UNII | 536BQ2JVC7 | 7XQ5AKD9YD |
| DSSTox / MDL | DTXSID9048431 / MFCD00868097 | DTXSID4048981 / MFCD10567436 |
| Wzór | C14H26N4O11P2 | C14H25N4NaO11P2 |
| Masa cząsteczkowa | 488,32 | 510,31 — cięższa o 21,99 g·mol−1 |
| Masa monoizotopowa | 488,10733165 | 510,08927590 |
| InChIKey | RZZPDXZPRHQOCG-OJAKKHQRSA-N | YWAFNFGRBBBSPD-OCMLZEEQSA-M |
| Jednostki kowalencyjnie związane | 1 | 2 — rekord dotyczy soli dwuskładnikowej |
| Wymieniony w specyfikacji nowej żywności UE | Tak, wyraźnie jako sól wewnętrzna [5] | Nie |
| Typowe nazwy handlowe | Somazina, Difosfocin, Recognan | Ceraxon; status w rejestrze Cytykolina sodowa [USAN] |
Klucze InChIKey różnią się pierwszym blokiem, który jest skrótem szkieletu. Jest to najsilniejsze możliwe stwierdzenie braku identyczności: nie są to dwie pisownie jednej substancji, lecz dwie różne substancje. Praktyczną konsekwencją jest arytmetyka. Stała odważka 1000 mg dostarcza 2,048 mmol jeśli jest to sól wewnętrzna i 1,960 mmol jeśli jest to sól sodowa — 4,3% mniej moli z tego samego odczytu na tej samej wadze. Krzywa kalibracyjna zbudowana na błędnym założeniu jest obciążona o tę wartość przed pierwszym wstrzyknięciem, a żadna staranność chromatograficzna tego nie naprawi.
Ta sama pułapka w bardziej znanej formie jest powodem chlorowodorek prokainy jest opisany na swojej stronie jako sól, a nie zasada: przeciwjon jest częścią masy cząsteczkowej, a masa cząsteczkowa jest jedyną rzeczą, która przelicza masę na liczbę moli.
Wyszukiwanie wzoru i masy dla tej substancji może prowadzić do rekordu, który stwierdza, że ma ona cztery nieokreślony centra stereogeniczne. Wpis w rejestrze CID 13013858, zarejestrowany pod nazwą Cytidyna-5′-difosfocholina, nosi identyczny wzór sumaryczny C14H26N4O11P2, identyczną masę cząsteczkową 488,32 oraz identyczną masę monoizotopową 488,10733165 [3]. Jego identyfikator InChIKey to RZZPDXZPRHQOCG-UHFFFAOYSA-N — ten sam pierwszy blok co autentyczny rekord, różniący się tylko warstwą stereochemiczną, a jego liczniki deskryptorów stereo wskazują określone 0, nieokreślone 4. Jest to płaska reprezentacja tej samej konektywności: ta sama cząsteczka narysowana bez jej stereochemii.
Ma to znaczenie ze względu na to, jak zwykle automatyzuje się sprawdzanie tożsamości. Skrypt dopasowujący po wzorze i dokładnej masie — dwóch polach, które podaje każdy spektrometr mas — w ogóle nie potrafi rozróżnić tych dwóch rekordów, a jeśli trafi na płaski, zgłosi substancję z czterema nierozstrzygniętymi stereocentrami. To istotnie inne stwierdzenie niż to, co mówi autentyczny rekord, i dokładnie takie, które skierowałoby kupującego na poszukiwanie rozdziału chiralnego, którego ten związek nie potrzebuje (sekcja 4).
Obraz uzupełniają cztery kolejne rekordy, które wyszukiwanie zwraca dla tych samych nazw lub tego samego wzoru [1][2][4]:
| Rekord | Czym jest | Jak je odróżnić |
|---|---|---|
| CID 13804 | Autentyczna wewnętrzna sól, pełna warstwa stereochemiczna | InChIKey kończy się na -OJAKKHQRSA-N; cztery określone centra stereogeniczne |
| CID 13013858 | Ta sama konektywność, brak stereochemii | InChIKey kończy się na -UHFFFAOYSA-N; cztery nieokreślony centra stereogeniczne; ten sam wzór i ta sama dokładna masa |
| CID 13805 | protonowany kation, C14H27N4O11P2+, masa 489,33 | InChIKey kończy się na -OJAKKHQRSA-O — ostatnia litera, a nie środkowy blok, uległa zmianie |
| CID 36605 | Sól sodowa | Zupełnie inny skrót szkieletu; dwie jednostki kowalencyjne |
| Dwa zduplikowane wpisy | Jeden powtarza InChIKey soli wewnętrznej, ale liczy dwie jednostki kowalencyjne; drugi powtarza InChIKey soli sodowej | Zwykłe porządki w rejestrze, ale system docelowy uzgadniający jeden wpis z drugim zgłosi niezgodność, która nie jest rzeczywista |
Wyszukiwanie nazwy dla cytykolina zwraca dziesiątki identyfikatorów. Liczbą, która jest jednoznaczna, nie jest nazwa ani masa — jest to pełny identyfikator InChIKey, a dla opisywanego tutaj materiału wynosi RZZPDXZPRHQOCG-OJAKKHQRSA-N.
Autentyczny rekord zawiera listę o nazwie usunięte synonimy — ciągi, które były kiedyś do niego przypisane i zostały od tego czasu wycofane. Wśród 51 pozycji na tej liście znajduje się dokładnie jeden ciąg w formacie CAS: 125602-26-8. Sprawdzenie tego numeru nie zawodzi. Prowadzi bez błędu do całkowicie niepowiązanej substancji: chronionej pochodnej argininy o wzorze C22H36N4O7S i masie cząsteczkowej 500,6 [1].
To jest zanieczyszczenie rekordu, a nie wycofany numer CAS dla cytykoliny; substancja nie ma przestarzałych numerów rejestrowych, które moglibyśmy znaleźć. Niebezpieczeństwo jest specyficzne i mechaniczne: skrypt zbierający ciągi w formacie CAS z listy synonimów, zamiast czytać pojedyncze autorytatywne pole, wybierze numer dla innego związku, którego masa jest na tyle bliska (500,6 w porównaniu do 488,32), że nie wygląda to absurdalnie. Prawidłowy i jedyny numer CAS dla opisanej tutaj substancji to 987-78-0, potwierdzony niezależnie przez rejestr [1] oraz przez tekst rozporządzenia europejskiego [5].
Opisy "cytrynianu CDP-choliny" krążą w ofertach handlowych. Nie istnieje żadna sól cytrynianowa cytykoliny w żadnym rejestrze, do którego mamy dostęp, i nie jest to substancja opisana przez prawo europejskie. Rozporządzenie wyraźnie określa skład: “Cytykolina składa się z cytozyny, rybozy, pirofosforanu i choliny” [5]. W tej cząsteczce nie ma cytrynianu, w żadnej formie handlowej ani w autoryzowanej specyfikacji. Istnieją dwie formy wymienione w sekcji 3.1. Podobnie, wartości około 18,5% choliny krążą w ofertach handlowych tego materiału; nie są to wartości z rejestru. Obliczenia na masach z rejestru dają 21,33% dla wewnętrznej soli (104,17 podzielone przez 488,32) i 20,41% dla soli sodowej (104,17 podzielone przez 510,31). Wartość bliską 18,5% osiąga się tylko przy założeniu, że jest to sól sodowa uwodniona — czyli zakładając trzecią formę, która nie odpowiada opisowi CAS nr 987-78-0.
Rejestr jednoznacznie określa stereochemię tego związku. Cytat dosłowny z rekordu [1]:
| Liczba określonych atomowych centrów stereogenicznych | 4 |
|---|---|
| Liczba nieokreślonych atomowych centrów stereogenicznych | 0 |
| Liczba określonych wiązaniowych centrów stereogenicznych | 0 |
| Liczba nieokreślonych wiązaniowych centrów stereogenicznych | 0 |
| Jednostki kowalencyjnie związane | 1 |
| Liczba atomów izotopowych | 0 |
Cztery zdefiniowane, zero nieokreślonych. Związek jest pojedynczym, w pełni określonym stereoizomerem, a nie mieszaniną ani częściowo rozdzieloną strukturą. Konfiguracja jest zawarta w nazwie systematycznej jako (2R,3S,4R,5R) i w izomerycznym ciągu SMILES jako cztery jawne, oznaczone stereochemicznie centra; drugi blok w InChIKey, OJAKKHQRSA, jest skrótem tej warstwy stereochemicznej, dlatego różni się od płaskiego rekordu omówionego w sekcji 3.2.
Wszystkie cztery centra znajdują się na jednej małej części cząsteczki: na pierścieniu β-D-rybofuranozowym połowy cytydynowej. C-1′ niesie wiązanie glikozydowe z azotem cytozyny i ustala konfigurację anomeryczną; C-2′ i C-3′ niosą dwie drugorzędowe grupy hydroksylowe; C-4′ niesie egzocykliczny węgiel prowadzący do fosforanu. Połowa cholinowa cząsteczki nic nie wnosi: to prosty łańcuch dwóch węgli między czwartorzędowym azotem a tlenem, bez żadnego centrum stereogenicznego.
Żaden atom fosforu nie jest centrum stereogenicznym, i warto to wyraźnie stwierdzić, ponieważ intuicja podpowiada inaczej. Czterowartościowy fosfor z czterema różnymi podstawnikami jest stereogeniczny, a stereochemia fosforu jest rzeczywistym i istotnym polem w chemii nukleotydów. Nie ma to zastosowania tutaj. W cytykolinie każdy atom fosforu ma dwa równoważne atomy tlenu: formalnie podwójnie związany tlen oraz tlen hydroksylowy lub tlenkowy, które są wymieniane przez tautomerię i rezonans, dlatego te dwie pozycje nie są rozróżnialnymi podstawnikami. Ten sam obraz występuje przy obu atomach fosforu. Dwa identyczne podstawniki oznaczają, że atom w ogóle nie jest centrum stereogenicznym, co jest dokładnie powodem, dla którego rejestr liczy cztery, a nie sześć. Dokument dostawcy lub świadectwo analizy twierdzące o „chiralnym centrum fosforu” dla tej substancji twierdziłyby coś, czemu zbiór deskryptorów przeczy.
Ponieważ związek jest pojedynczym zdefiniowanym stereoizomerem bez nieokreślonych centrów, chromatografia chiralna nie jest tutaj problemem identyfikacji. To jest prawdziwa różnica w porównaniu z innymi kartami w tym katalogu. Tadalafil zawiera dwa określone centra i dzieli swoją dokładną masę z rodziną stereoizomerów, których spektrometria mas nie może rozdzielić, więc dla tego związku kwestia chiralności jest kwestią tożsamości. W przypadku cytykoliny stereochemia jest zachowana w całości od rybozy biologicznego lub syntetycznego materiału wyjściowego, a żaden realistyczny proces produkcyjny nie wytwarza niewłaściwego diastereoizomeru jako składnika masowego.
Stereochemia oznacza natomiast to, że konfiguracja rybozy dotyczy tej części cząsteczki, którą atakuje degradacja, a nie tej, którą psuje produkcja. Rozszczepienie wiązania glikozydowego uwalnia wolną cytozynę; hydroliza mostka difosforanowego uwalnia kwas 5′-cytydylowy i fosforan. Oba procesy niszczą nietkniętą cząsteczkę, pozostawiając fragmenty chemicznie do niej podobne i chromatograficznie bardzo jej bliskie. Stereochemia jest stabilna; konektywność wokół niej - nie. Tym zajmują się trzy kolejne sekcje.
Ponownie przeczytaj obliczone deskryptory jako zestaw, ponieważ razem zamykają niemal wszystkie standardowe możliwości analityczne naraz [1]:
| Deskryptor | Wartość | Konsekwencja analityczna |
|---|---|---|
| XLogP3 | −4 | Znacznie bardziej polarny, niż jakakolwiek faza stacjonarna w odwróconym układzie faz jest w stanie zatrzymać. Analit przechodzi do fazy ruchomej i opuszcza z nią kolumnę |
| Topologiczna powierzchnia polarna | 214 Å2 | Skrajnie polarna powierzchnia. W połączeniu z wartością logP jest to liczbowy zapis stwierdzenia “to wyeluuje się w objętości martwej” |
| Donory/akceptory wiązań wodorowych | 4 / 11 | Silna solwatacja w wodzie; hydrofilowa faza stacjonarna ma z czym wchodzić w interakcje, łańcuch C18 prawie nic |
| Ładunek formalny | 0, ale jako jon obojnaczy | Czwartorzędowa grupa amoniowa jest dodatnio naładowana przy każdym pH. Nie może być zneutralizowana przez bufor, więc zmiana pH fazy ruchomej nie wyłącza stanu naładowania |
| Wiązania rotacyjne | 10 | Konformacyjnie elastyczny; retencja i zachowanie w ruchliwości jonów są uśrednione dla wielu konformerów |
| Atomy ciężkie / złożoność | 31 / 821 | Duża, bogata w informacje cząsteczka — dlatego jej fragmentacja jest informatywna, nawet jeśli jej retencja nie jest |
Trwały ładunek kationowy to część, która zaskakuje. W przypadku zwykłej aminy podniesienie pH przekształca jon amoniowy w wolną zasadę i retencja wraca. Czwartorzędowy jon amoniowy nie ma protonu do oddania: pozostaje naładowany w kwasie, w zasadzie i wszędzie pomiędzy. L-DOPA stanowi przydatny kontrast w tym katalogu — również bardzo polarny, słabo zatrzymywany jon obojnaczy, ale taki, którego stan naładowania rzeczywiście reaguje na pH, a jego pierwszorzędowa grupa aminowa daje uchwyt do derywatyzacji. Cytykolina nie oferuje ani jednego, ani drugiego.
A oto dlaczego słaba retencja nie jest tylko uciążliwa, ale diagnostycznie śmiertelna. Produkty własnej degradacji związku to także bardzo polarne nukleotydy: kwas 5′-cytydylowy z hydrolizy mostka difosforanowego, cytydyna po dalszej utracie fosforanu oraz sam wolny fosforan. Na kolumnie odwróconej fazy eluują one również w objętości martwej — w tym samym niezatrzymanym paśmie co związek macierzysty. Chromatogram pokazujący jeden pik nie jest zatem dowodem na obecność jednej substancji; jest dowodem, że nic się nie rozdzieliło. Oba zanieczyszczenia, które prawo europejskie wymienia dla tej substancji z nazwy i limituje liczbowo [5], znajdują się wewnątrz tego piku.
Literatura potwierdza, że jest to rzeczywista trudność, a nie lokalny problem, i robi to w sposób wyjątkowo ostry. Jedyne opublikowane badanie biorównoważności cytykoliny — badanie regulacyjne przeprowadzone prawidłowo, opublikowane w recenzowanym czasopiśmie analitycznym — oznaczyło ilościowo cholinę, metabolit, a nie samą cytykolinę [23]. Tytuł mówi o tym wyraźnie. Gdy badanie rejestracyjne mierzy produkt rozpadu zamiast substancji macierzystej, pomiar tej ostatniej nie jest łatwy.
| Standardowa technika | Dlaczego zawodzi dla tego analitu |
|---|---|
| Retencja w fazie odwróconej C18 | XLogP3 −4, TPSA 214 Å2. Analit eluuje w objętości martwej lub w jej pobliżu, razem z własnymi produktami hydrolizy |
| Sterowanie retencją za pomocą pH | Czwartorzędowa grupa amoniowa jest naładowana przy każdym pH. Nie ma formy obojętnej, którą można by uzyskać |
| Detekcja UV jako test tożsamości | Pierścień cytozyny pochłania promieniowanie ultrafioletowe, dlatego w pracach związanych z nukleotydami rutynowo stosuje się UV [27]. Jednak dla tego związku nie zdeponowano widma ultrafioletowego ani maksimum absorpcji [1], więc współczynnik odpowiedzi nie jest publicznie ustalony — a produkty rozkładu niosą ten sam chromofor, więc UV nie może ich odróżnić |
| Chromatografia gazowa | Trwale naładowany, nielotny jon obojnaczy. Nie ma zdeponowanego widma GC-MS i nie powinno być |
| Derywatyzacja w celu dodania retencji | Oczywiste punkty zaczepienia nie są dostępne: brak aminy pierwszorzędowej lub drugorzędowej, a derywatyzacja grupy hydroksylowej na rybozie konkuruje z chemią fosforanową |
| Dopasowanie do biblioteki na podstawie dokładnej masy | Dopasowuje się równie dobrze do płaskiego rekordu i autentycznego rekordu (sekcja 3.2), nie może odróżnić żadnego od współelutującego związku izobarycznego |
Są to punkty wyjścia do opracowywania metod, oparte na opublikowanych pracach, a nie zwalidowane procedury, i są oferowane jako takie:
Porównajmy, jak różnie wygląda to w przypadku związków, których wykrycie jest trywialne. Błękit metylenowy jest intensywnie zabarwiony i można go oznaczyć ilościowo przez pomiar absorbancji niemal bez staranności; mebicar znajduje się na przeciwnym biegunie, nie posiadając w ogóle użytecznego chromoforu. Cytykolina zajmuje niewygodne miejsce pośrodku: ma chromofor, jest on jednak wspólny dla każdego z jej produktów rozkładu, więc detektor, który ją widzi, nie może powiedzieć, co dokładnie widzi.
Większość substancji w katalogu takim jak ten nie ma żadnej prawnie wiążącej specyfikacji. Cytykolina jest wyjątkiem, a ten wyjątek jest przydatny, ponieważ rozporządzenie wykonawcze Komisji (UE) 2017/2470 — unijny wykaz nowych środków spożywczych — zawiera pełną specyfikację monograficzną dla niej. Nie są to dane marketingowe; są to liczby, które pojawiają się w Dzienniku Urzędowym [5].
| Parametr | Wartość w rozporządzeniu |
|---|---|
| Opis | “Cytykolina składa się z cytozyny, rybozy, pirofosforanu i choliny. Biały krystaliczny proszek” |
| Wzór chemiczny | C14H26N4O11P2 |
| Masa cząsteczkowa | 488,32 g/mol |
| Numer CAS | 987-78-0 |
| pH roztworu 1% | 2,5-3,5 |
| Zawartość | ≥98% suchej masy |
| Strata podczas suszenia, 100 °C przez 4 godziny | ≤5,0% |
| Kwas 5′-cytydylowy | ≤1,0% |
| Wolne kwasy fosforowe | ≤0,1% |
| Jony amonowe | ≤0,05% |
| Arsen | Nie więcej niż 2 ppm |
| Ogólna liczba drobnoustrojów | ≤103 CFU/g |
| Drożdże i pleśnie | ≤102 CFU/g |
| Escherichia coli | Brak w 1 g |
| Dopuszczalne źródła | Syntetyczne; i mikrobiologiczne, „produkowane przez fermentację z użyciem genetycznie zmodyfikowanego szczepu E. coli (BCT19/p40k)”, o identycznej specyfikacji |
Teraz umieść tę tabelę obok jedynego widma, które zawiera rekord publiczny. Zdeponowane widmo mas z chromatografii cieczowej dla deprotonowanej cząsteczki, [M−H]− przy m/z 487,09953, ma te pięć najintensywniejszych fragmentów [13]: 428,0274 (pik podstawowy), 78,9601, 304,0353, 110,0364 i 122,9852. Należy je odczytać w kontekście limitów zanieczyszczeń powyżej oraz uważnie przeanalizować dokładne masy, ponieważ jedną z nich łatwo pomylić. Pik podstawowy przy 428,0274 jest utratą 59,07 jednostki masy względem prekursora: to neutralna strata trimetyloaminy z końca cholinowego. Fragment przy 304,0353 jest częścią cząsteczki odpowiadającą monofosforanowi cytydyny, uwalnianą przez rozszczepienie mostka difosforanowego — ale w swojej cyklicznej, odwodnionej formie: dokładna masa zgadza się z C9H11N3O7P−, obliczona wartość wynosi 304,034. Zdeprotonowany kwas 5′-cytydylowy sam w sobie jest m/z 322,045, o osiemnaście jednostek masy wyżej, a świadectwo, które oznacza 304 jako kwas cytydylowy, przypisało go błędnie o cząsteczkę wody. Fragment przy 78,9601 jest anionem metafosforanowym PO3− (obliczona wartość 78,959), bezpośredni marker uwalniania fosforanu. Fragment przy 122,9852 jest nie formą wolnego fosforanu: odpowiada C2H4O4P− przy 122,985 z dokładnością do jednej dziesiątej milijednostki masy — fosforylowana dwuwęglowa pozostałość ramienia cholinowego po odejściu trimetyloaminy. Diwodorofosforan dawałby 96,970. Fragment przy 110,0364 jest zdeprotonowaną cytozyną (obliczona masa 110,036), powstałą w wyniku rozszczepienia wiązania glikozydowego.
Odczytane w ten sposób widmo wciąż mówi coś, co mówi również specyfikacja: dwa wiązania, które pękają jako pierwsze w komorze zderzeń, to te same dwa wiązania, których hydroliza daje zanieczyszczenia wymienione w rozporządzeniu — mostek P–O–P, który daje fragment monofosforanu cytydyny i wolny fosforan, oraz wiązanie glikozydowe, które daje cytozynę. Mostek difosforanowy i wiązanie glikozydowe są najsłabszymi punktami tej cząsteczki zarówno w spektrometrze mas, jak i w fiolce z próbką. Czego widmo nie robi, to podawanie regulowanych zanieczyszczeń przy ich masach nominalnych; jony fragmentacyjne są odwodnione i przegrupowane względem nienaruszonych cząsteczek zanieczyszczeń, a traktowanie masy fragmentu jako masy zanieczyszczenia to błędna identyfikacja, która tylko czeka, by się wydarzyć.
Dwie uczciwe uwagi należy dodać do tego akapitu. Po pierwsze, przypisania fragmentów powyżej są nasz odczyt zdeponowanych mas — każdy sprawdzony względem obliczonego składu pierwiastkowego, zgodny ze znaną chemią nukleotydowych difosforanów, ale nie jest to cytat z opublikowanej analizy fragmentacji; takiej publikacji dla tego związku nie odnaleziono. Po drugie — i ważniejsze dla każdego traktującego to jako specyfikację — przytoczony tu przepis jest prawem żywnościowym, a nie farmakopealnym. Jest to zatwierdzona specyfikacja dla cytykoliny jako nowego składnika żywności w Unii Europejskiej. Nie ustaliliśmy i nie twierdzimy, czy istnieje monografia dotycząca tej substancji w Farmakopei Europejskiej lub Amerykańskiej; są to różne teksty podlegające innemu reżimowi prawnemu, a oba nie powinny być mylone.
W tej sekcji każda liczba jest przypisana do źródła, które ją zawiera, ponieważ dla tego związku źródła obejmują różne aspekty i jedno z nich jest tekstem prawnym, a nie pomiarem. W przypadku rozbieżności wartości rozbieżność jest pokazana, a nie rozwiązana.
Sekcja właściwości eksperymentalnych rekordu zawiera jedną klasę pomiarową i nic więcej: przekrój czynny zderzeń z pomiarów ruchliwości jonów w rurze dryfowej [1]. Nie ma temperatury topnienia, nie ma temperatury wrzenia, brak danych o rozpuszczalności w jakimkolwiek rozpuszczalniku, brak stałej dysocjacji kwasowej, gęstości, współczynnika załamania światła, skręcalności właściwej oraz opisu fizycznego. Jest to ustalenie dotyczące rekordu, dokonane na podstawie przeglądu całości, a nie brakująca informacja w wynikach wyszukiwania.
| Jon | Wartość (Å2) | Metoda wg rekordu |
|---|---|---|
| [M+H]+ | 197,6 | Rura dryfowa, pojedyncze pole, skalibrowana komercyjną mieszanką kalibracyjną |
| [M+H]+ | 198,86 | Rura dryfowa, pole schodkowe |
| [M+H]+ | 198,3 | Rura dryfowa, pojedyncze pole, niskostężeniowa mieszanka kalibracyjna |
| [M−H]− | 200,64 | Rura dryfowa, pojedyncze pole, komercyjna mieszanka kalibracyjna |
| [M−H]− | 208,41 | Rura dryfowa, pole schodkowe |
| [M−H]− | 205,9 | Rura dryfowa, pojedyncze pole, niskostężeniowa mieszanka kalibracyjna |
| [M+Na]+ | 208,98 i 207,8 | Pole schodkowe; pojedyncze pole, mieszanka dla niskich stężeń |
| [M+Na−2H]− | 210,2 | Rura dryfowa, pojedyncze pole, mieszanka niskostężeniowa |
Zwróć uwagę na rozrzut wartości jonów ujemnych: 200,64, 205,9 i 208,41 Å2 dla tego samego jonu tej samej cząsteczki, zakres wynoszący prawie 4%. Nie jest to sprzeczność wymagająca rozwiązania poprzez wybór jednej z opcji; tak się dzieje, gdy mierzy się elastyczną cząsteczkę z dziesięcioma wiązaniami rotacyjnymi względem trzech różnych kalibracji. Każdy używający przekroju czynnego zderzeń jako kryterium identyfikacji powinien dopasować kalibrację, a także liczbę.
Jedyne oficjalne stwierdzenia dotyczące wyglądu i zachowania tego materiału w postaci stałej nie pochodzą z bazy danych chemicznych, ale z unijnego wykazu [5]: biały krystaliczny proszek, a pH 2,5–3,5 dla roztworu 1%. Druga liczba jest bardziej informacyjna, niż się wydaje. Jednoprocentowy roztwór wodny tego związku jest wyraźnie kwaśny, co wynika z wolnej grupy hydroksylowej na mostku fosforanowym i ma bezpośrednie znaczenie dla stabilności roztworu — mostek difosforanowy nie jest najbardziej stabilny w środowisku kwaśnym.
To, że substancja jest rzeczywiście krystaliczna, zostało niezależnie potwierdzone przez najstarszą literaturę na jej temat: krystalizację z drożdży opisano w 1956 roku [15], a strukturę molekularną rozwiązano za pomocą dyfrakcji rentgenowskiej w 1975 roku [14]. Publikacja z 1975 roku pozostaje jedynym określeniem krystalograficznym tej cząsteczki, które udało nam się zidentyfikować, i dlatego jest jedynym twardym punktem odniesienia dla jakichkolwiek stwierdzeń dotyczących konformacji lub geometrii stanu stałego.
Jeden artykuł z indeksu biomedycznego poświęcony jest wyraźnie charakterystyce fizykochemicznej tego związku. Został opublikowany w 1983 roku, jest indeksowany pod numerem PMID 6684450 i nie ma identyfikatora obiektu cyfrowego ani żadnego rekordu międzywydawczego [16]. Jest w pełnym tego słowa znaczeniu poza cyfrowym obiegiem danych chemicznych: zawartych w nim wartości nie da się odnaleźć przez identyfikator, zacytować linkiem ani pobrać automatycznie. Zwróć też uwagę na drobny szczegół bibliograficzny, który niedbałe cytowanie pomyli — numer zeszytu to 7A, nie 7.
Przeczytaj to obok pustej sekcji eksperymentalnej rekordu w rejestrze, a sytuacja stanie się jasna. To nie jest substancja, której nikt nie zmierzył. To substancja, której pomiary wykonano cztery dekady temu, w wydaniu czasopisma, które nigdy nie otrzymało trwałego identyfikatora, i nigdy nie trafiły do baz danych, gdzie współczesne laboratorium szuka informacji. Temperatura topnienia określona na własnym materiale dzisiaj byłaby daną, która obecnie nie jest publiczna.
Nie istnieje wartość rozpuszczalności dla tego związku w rejestrze, niezależnie od użytego rozpuszczalnika [1]. Bez wymyślania czegokolwiek można stwierdzić: zwitterioniczny nukleotyd o obliczonej wartości logP równej −4 i powierzchni polarnej wynoszącej 214 Å2 jest związkiem rozpuszczalnym w wodzie i słabo rozpuszczalnym w niepolarnych rozpuszczalnikach organicznych, a samo rozporządzenie wykorzystuje 1% roztwór wodny jako warunek testu pH [5], co dowodzi, że co najmniej takie stężenie się rozpuszcza. Poza tym nie podajemy żadnej wartości, ponieważ jej nie ma. Określ ją na swoim materiale i zanotuj temperaturę, gdy to robisz.
Kontrast z lepiej scharakteryzowanym końcem tego katalogu jest pouczający. Dla związku takiego jak paracetamol, dekady pracy farmakopealnej sprawiły, że zakres temperatur topnienia, rozpuszczalność i widma są stabelaryzowane i wzajemnie spójne. Dla cytykoliny — związku o dłuższej historii klinicznej niż większość oferty katalogowej — odpowiednia tabela jest pusta. Wolumen zastosowań klinicznych i charakterystyka analityczna to niezależne wielkości, a ta substancja jest najwyraźniejszym przykładem luki między nimi.
| Technika | Obecne | Szczegóły i ograniczenia |
|---|---|---|
| MS/MS, jony dodatnie | Tak | Wpis do biblioteki referencyjnej 1053658; prekursor [M+H]+ m/z 489,1146; pułapka jonowa, MS2; 13 pików; trzy najintensywniejsze przy 378,2, 360,2, 264,2 |
| MS/MS, jony ujemne | Tak | Wpis biblioteczny 1170509; prekursor [M−H]− 487,1001; 28 pików; trzy najintensywniejsze przy 336, 428, 416 |
| MS/MS, podwójnie naładowany | Tak | Wpis biblioteczny 1170468; prekursor [M+2H]2+ 245,0609; 97 pików; trzy najintensywniejsze przy 112, 360, 378 |
| LC-MS | Tak | Dwa depozyty, PT207070 i PT201910; [M−H]− 487,09953; kwadrupol z analizatorem czasu przelotu, ujemna jonizacja elektrosprej, rampa zderzeniowa 5–45 V; hash strukturalny splash10-004i-6505900000-fc13e5ad403e7faf8218 [13] |
| 1H NMR | Nie | — |
| 13C NMR | Nie | — |
| 31P NMR | Nie | Dla cząsteczki zawierającej 12,69% fosforu masowo. Zobacz poniżej |
| Podczerwień | Nie | Brak jakichkolwiek widm, ani w fazie skondensowanej, ani w fazie gazowej |
| Raman | Nie | Słowo pojawia się w rekordzie tylko wewnątrz ogólnego opisu tego, co mogą zawierać sekcje widmowe — nie jako dane |
| Spektroskopia UV-Vis | Nie | Pomimo że chromofor cytozynowy jest podstawą rutynowego wykrywania nukleotydów [27] |
| GC-MS | Nie | Oczekiwane: nielotny, trwale naładowany jon obojnaczy |
| Dyfrakcja proszkowa, NMR w stanie stałym | Nie | Brak informacji o polimorfizmie jakiegokolwiek rodzaju; struktura jednokrystaliczna z 1975 roku [14] jest jedyną daną dotyczącą stanu stałego |
Fosfor-31 jest bliski idealnemu jądru dla tego problemu. Ma spin połówkowy, a ponadto występuje naturalnie w 100%, a jego zakres przesunięcia chemicznego jest na tyle szeroki, że mostek difosforanowy, monoester fosforanowy i wolny nieorganiczny fosforan zajmują wyraźnie oddzielone regiony widma. Jeden ilościowy pomiar 31P odpowiada zatem na pytanie, wokół którego zbudowana jest specyfikacja tej cząsteczki — czy mostek P–O–P jest nienaruszony oraz ile monofosforanu i wolnego fosforanu jest obecne — bez separacji chromatograficznej, bez chromoforu i bez konieczności wyznaczania współczynnika odpowiedzi dla detektora ultrafioletowego.
W publicznym rekordzie tego związku nie ma takiego widma referencyjnego. I nie jest to artefakt miejsca, w którym szukaliśmy: przeszukanie indeksu biomedycznego pod kątem tej substancji w połączeniu z NMR fosforu zwraca cztery publikacje, a wszystkie cztery to badania in vivo lub in cellulo — wykrycie CDP-choliny w hodowlach komórek nowotworowych, gdzie wykazano, że położenia sygnałów zależą od pH [24], oraz akumulacja związku w erytrocytach w chorobie hemolitycznej [25]. Żadna z nich nie jest charakterystyką materiału odniesienia. Jądro zostało wykorzystane do wykrycia tej cząsteczki w tkance; nigdy nie zostało publicznie użyte do certyfikacji jej próbki.
Praktyczna konsekwencja. Laboratorium, które chce zweryfikować integralność mostka difosforanowego przez 31P NMR dysponuje odpowiednim sprzętem, jądrem oraz opublikowanym przykładem zastosowania tej techniki dla blisko spokrewnionego fosforanu choliny [26] — ale brak referencyjnego widma cytykoliny do porównania oraz brak opublikowanych przypisań przesunięć dla nienaruszonego związku w stanie stałym lub w roztworze wzorcowym. Wiadomo, że położenia sygnałów przesuwają się wraz z pH [24], a 1% roztwór tej substancji ma pH 2,5–3,5 [5], więc nie można też swobodnie zapożyczyć danych referencyjnych z badania przy fizjologicznym pH. Ktoś musi raz zarejestrować widmo uwierzytelnionej próbki przy podanym pH — i ta próbka musi być próbką uwierzytelnioną. To jest argument za posiadaniem scharakteryzowanego materiału zamiast polegania na dopasowaniu do bazy danych.
Zdeponowane widma mas są rzeczywiście przydatne i powinny być wykorzystywane. Zestaw fragmentów w trybie jonów ujemnych daje bezpośredni odczyt dwóch regulowanych klas zanieczyszczeń (sekcja 7), a podwójnie protonowany prekursor generuje bogate widmo składające się z 97 pików, które jest znacznie bardziej charakterystyczne niż jakiekolwiek pojedyncze przejście. Czego spektrometria mas nie może tu zrobić, to odróżnić autentyczną, stereochemicznie zdefiniowaną substancję od konektywności płaskiego rekordu (sekcja 3.2), ponieważ to ten sam zbiór atomów w tym samym układzie; nie rozstrzygnie też, czy posiadany materiał jest solą wewnętrzną, czy sodową, jeśli sód zostanie oderwany lub przyłączony w źródle jonów. To pytania do świadectwa i składu pierwiastkowego, a nie do spektrometru mas.
Literatura dotycząca cytykoliny jest obszerna. Jest ona również rozłożona bardzo nierównomiernie, a to właśnie rozkład — nie suma — jest tym, co laboratorium kupujące wzorzec musi znać. Poniższe pomiary zostały wykonane z użyciem kontroli pozytywnych, aby niską wartość można było odróżnić od nieudanego zapytania.
| Zapytanie | Dokumentacja | Odczyt |
|---|---|---|
| Cross-publisher index, cytykolina | 658 | Porównanie: piracetam 863, modafinil 1849, paracetamol 14 703, kofeina 23 272. Skromna suma jak na pięćdziesiąt lat stosowania farmaceutycznego |
| Indeks biomedyczny, paracetamol i HPLC | 1,359 | Kontrola pozytywna — zapytanie działa |
| Indeks biomedyczny, cytykolina i HPLC | 30 | Trzydzieści prac naukowych, większość z nich o charakterze klinicznym, a nie metodologicznym |
| Indeks biomedyczny, nukleotydy z chromatografią par jonowych | 326 | Kontrola pozytywna — metodyka istnieje dla klasy związków |
| Indeks biomedyczny, cytykolina z wykorzystaniem chromatografii z parami jonowymi lub chromatografii oddziaływań hydrofilowych | 2 | W porównaniu z kontrolą wynoszącą 326 dla tej klasy, jest to rzeczywista luka metodologiczna, a nie błąd zapytania |
| Indeks biomedyczny, cytykolina z wykorzystaniem spektroskopii NMR fosforu | 4 | Wszystkie cztery dotyczą badań in vivo lub w komórkach; brak informacji o wzorcu analitycznym (sekcja 9) |
| Indeks biomedyczny, cytykolina w połączeniu z hasłami: kryształ, rentgen, polimorf lub forma stała | 18 | Nieliczne i zdominowane przez historyczne prace strukturalne [14][15] |
| Indeks biomedyczny, cytykolina z wykorzystaniem fermentacji lub syntezy enzymatycznej | 20 | Aktualna literatura produkcyjna — sekcja 10.2 |
Wzorzec w literaturze analitycznej jest na tyle niezwykły, że warto go bezpośrednio stwierdzić. Trzy opublikowane metody ilościowe oznaczają cytykolinę za pomocą chromatografii lub spektroskopii optycznej, a wszystkie trzy oznaczają ją w tej samej kombinacji — z piracetamem: metoda chromatograficzna umożliwiająca ocenę stabilności dla pary [19], metoda spektrofluorometryczna dla cytykoliny w obecności piracetamu występującego w tej samej formulacji [21] oraz metoda spektrofotometryczna dla pary w postaci tabletek [22]. Dwie z tych trzech prac pochodzą z tego samego laboratorium. Pozycje [19] i [21] zawierają identyczny zestaw pięciu autorów — Abdelrahman, Ahmed, Omar, Derayea i Abdelwahab — wymienionych w innej kolejności; tylko [22] jest niezależną grupą. Liczba cytowań wynosząca trzy zawyża zatem niezależną podstawę metodologiczną, która wynosi dwa. Dodatkowo istnieje metoda potencjometryczna wykorzystująca elektrodę jonoselektywną, która jest jedyna w swoim rodzaju [20], oraz nowoczesne rozdzielenie chromatograficzne pary fosfocholina / CDP-cholina opracowane do pracy z testami enzymatycznymi [18].
Czego brakuje na tej liście, to zwalidowana, samodzielna metoda chromatograficzna umożliwiająca ocenę stabilności dla cytykoliny jako pojedynczej substancji. Najbliższa opublikowana praca dotyczy metody dla mieszaniny; najbardziej rygorystyczna opublikowana praca bioanalityczna mierzyła zamiast niej metabolit [23]. Dlatego sekcja 6 oferuje punkty wyjścia a nie procedur.
Prawo europejskie dopuszcza cytykolinę z dwóch źródeł o identycznej specyfikacji: syntezy chemicznej oraz fermentacji z wykorzystaniem genetycznie zmodyfikowanego E. coli szczepu [5]. Obie metody mają swoją literaturę i rozróżnienie ma znaczenie dla kupującego, ponieważ profile śladowych zanieczyszczeń różnią się nawet tam, gdzie główna specyfikacja nie.
Biosyntetyczna definicja cząsteczki sięga 1957 roku [28]. Przemysłowa droga fermentacji wywodzi się z enzymatycznej produkcji pirymidynowych nukleotydów przy użyciu Corynebacterium ammoniagenes i rekombinowanych E. coli komórek, opisanej w 1997 roku [29] — najwcześniejszy znany nam precedens dotyczący szlaku tego rodzaju, który określa rozporządzenie, chociaż rozporządzenie identyfikuje dopuszczony szczep (BCT19/p40k), a żadne z konsultowanych przez nas źródeł nie wiąże tego szczepu z tym artykułem. Współczesne prace nad tym szlakiem obejmują systemy wieloenzymatyczne napędzane modułem dawcy ATP [32], inżynierię enzymów dla warunków wysokosolnych [33], produkcję w żywych komórkach poprzez inżynierię substratu i metabolizm energii [34] oraz projektowanie systemów jednoprocesowych do zastosowań przemysłowych [35]. Po stronie chemicznej, wydajna synteza związku i jego analogów została opublikowana w 2015 roku [30], a ulepszona droga selektywnej fosforylacji w 2016 roku [31]; przegląd z 2024 roku omawia całe pole [36]. Istnieje nawet demonstracja, że mostek difosforanowy może tworzyć się bez żadnego enzymu [37] — co jest przypomnieniem, że wiązanie powstające tak łatwo nie jest szczególnie silne.
Wszystko w tej podsekcji jest faktem bibliograficznym dotyczącym opublikowanej pracy. Żadne z tych stwierdzeń nie odnosi się do materiału sprzedawanego na tej stronie i żadne z nich nie stanowi twierdzenia o jakiejkolwiek właściwości lub działaniu tego odczynnika.
Rola biochemiczna związku w szlaku Kennedy'ego została przedstawiona w standardowym przeglądzie [38]. Przeglądy farmakologiczne dotyczące tego związku w kontekstach ośrodkowego układu nerwowego istnieją od 2005 roku [39], a najbardziej obszerne pojedyncze opracowanie, liczące osiemdziesiąt dziewięć stron, zostało opublikowane w 2022 roku [45]. Krytyczny przegląd z 2014 roku nosi tytuł, znacząco, Facts, Doubts and Unresolved Issues [41], a przegląd z 2019 roku autorstwa polskich badaczy w tytule pyta, czy jest to lepsza forma choliny — innymi słowy, stawia porównanie jako pytanie [42]. Duże międzynarodowe wieloośrodkowe randomizowane badanie w ostrym udarze niedokrwiennym zostało opublikowane w 2012 roku [43], a systematyczny przegląd Cochrane dotyczący tego wskazania ukazał się w 2020 roku [44]. Randomizowane badanie dotyczące funkcji pamięci u zdrowych starszych dorosłych zostało opublikowane w 2021 roku [46], a związek pozostaje przedmiotem badań w nowszych próbach, w tym protokole opublikowanym w 2024 roku dla badania nad urazami płuc [47].
Dwa ostrzeżenia bibliograficzne, których menedżer cytowań nie wskaże za Ciebie.
Po pierwsze, wycofanie publikacji. Szeroko cytowany artykuł mechanistyczny dotyczący CDP-choliny i aktywności fosfolipazy, opublikowany w ważnym czasopiśmie biochemicznym w 2006 roku, został wycofany w 2013 roku [40]. Nadal jest często cytowany, znajduje się w indeksach i wyszukiwanie prac mechanistycznych dotyczących tej substancji zwraca ten artykuł. Każdy przygotowujący bibliografię dla tego związku powinien szczególnie sprawdzić tę pozycję.
Po drugie, dwa przypadki niezgodności między indeksami dotyczące autorstwa. W przypadku pracy z 1956 roku dotyczącej krystalizacji [15], biomedyczny indeks i rejestr międzywydawczy wymieniają różnych pierwszych autorów; to samo dotyczy pracy z 2013 roku na temat spektrofotometrii [22]. Cytujemy obie zgodnie z zapisem rejestru międzywydawczego i odnotowujemy rozbieżność, zamiast cicho wybierać jedną. Trzecia rozbieżność dotyczy roku: jedna praca produkcyjna podaje rok 2016 jako rok rejestracji i rok 2017 jako rok wydania [32]; cytujemy rok wydania.
Każde stwierdzenie w tej sekcji zostało zweryfikowane względem wskazanego dokumentu, a każdy wynik negatywny został zweryfikowany z kontrolą pozytywną, która zadziałała na tym samym dokumencie. Wyszukiwanie zwracające zero wyników niczego nie dowodzi, dopóki nie zostanie wykazane, że narzędzie wskazuje właściwy tekst.
| Unia Europejska — prawo żywnościowe | Dopuszczona nowa żywność, wpisana na unijną listę z pełną specyfikacją [5]. Obowiązują limity ilościowe: suplementy diety są ograniczone do 500 mg dziennie, a środki spożywcze specjalnego przeznaczenia medycznego do 250 mg na porcję z maksymalną dawką 1000 mg dziennie. Rozporządzenie wymaga również, aby etykietowanie produktów zawierających cytykolinę “zawierało stwierdzenie, że produkt nie jest przeznaczony do spożycia przez dzieci”. Żaden z tych przepisów nie dotyczy artykułu sprzedawanego tutaj, który nie jest żywnością i nie jest przeznaczony do spożycia — jest cytowany, ponieważ stanowi autorytatywną opublikowaną specyfikację substancji |
|---|---|
| Unia Europejska — podstawa naukowa | Autoryzacja opiera się na opinii dotyczącej bezpieczeństwa wydanej w 2013 roku [6]. Odrębna opinia z 2024 roku oceniła oświadczenie zdrowotne dotyczące funkcji pamięci i stwierdziła dosłownie, że “nie ustalono związku przyczynowo-skutkowego” [7]. Przedstawiamy to jako to, czym jest: wynik oceny naukowej czyjegoś twierdzenia oraz powód, dla którego taka deklaracja nie pojawia się nigdzie na tej stronie |
| Polska — produkt leczniczy | Brak. Trzynaście zapytań w rejestrze krajowym — nazwa międzynarodowa oraz jej polskie i hiszpańskie odpowiedniki, celowo utworzony trzyliterowy rdzeń, a także dziewięć nazw handlowych używanych gdzie indziej — zwróciło zero wyników [10]. Kontrole: popularny lek przeciwbólowy zwrócił 43 rekordy, a zapytanie częściowe wskazało aktualny produkt weterynaryjny, co potwierdza, że dopasowanie podciągów działa prawidłowo, a zera nie są wynikiem błędu przy dokładnym dopasowaniu |
| Polska — substancje kontrolowane | Nieobjęta wykazem w jakimkolwiek wykazie środków odurzających, psychotropowych lub nowych substancji psychoaktywnych [11]. Kontrole na tym samym dokumencie: rdzeń amfetaminy występuje 27 razy, a kokaina 2 razy, co odpowiada oczekiwanym wartościom |
| Stany Zjednoczone | Nie jest to zatwierdzony lek. Wyszukiwanie krajowego kodu leku zwraca jeden rekord, którym jest niezatwierdzony produkt homeopatyczny, a nie lek zawierający cytykolinę. Substancja ta krąży tam w ramach przepisów dotyczących suplementów diety. Nieobjęta wykazem jako substancja kontrolowana: nazwa substancji oraz rdzenie cholina, cytydyna i CDP, nie występują ani razu w alfabetycznym wykazie substancji kontrolowanych [12], w tekście, w którym kontrole amfetamina (25 wystąpień), ketamina (2), kokaina (2) i modafinil (1) dały trafienia |
| Gdzie jest lekiem | Substancja posiada międzynarodową nazwę niezastrzeżoną citicoline i kod N06BX06, z odpowiednikiem weterynaryjnym QN06BX06 [8]. Jest ona zarejestrowana jako japońska zaakceptowana nazwa oraz opisana w bazie danych ścieżek metabolicznych powiązanej z japońską farmakopeą; jest sprzedawana jako lek w kilku krajach pod wymienionymi w sekcji 2 nazwami handlowymi. Podajemy to na podstawie adnotacji rejestrowych i literatury, a nie rejestrów krajowych, które moglibyśmy przeszukać bezpośrednio |
| Antydoping, 2026 | Niewymieniony z nazwy na Liście substancji i metod zabronionych 2026 [9]. Kontrole na bromantan (2 wystąpienia) i modafinil (4) w tym samym dokumencie dały trafienia, więc przyrząd działał. Szczególnie sprawdzono klasę stymulantów; substancja nie pojawia się ani w podsekcji substancji określonych, ani nieokreślonych |
| Oznaczenie hepatotoksyczności | Rejestr zawiera adnotację zbioru danych dotyczącego uszkodzenia wątroby klasyfikującą cytykolinę jako negatywną [1]. Jest to adnotacja bazodanowa dotycząca substancji, a nie stwierdzenie bezpieczeństwa dotyczące tego odczynnika |
Pułapka w samych metadanych regulacyjnych. W polu dotyczącym przepisów dla rekordu związku cytowane jest Regulation (EC) No 258/1997 jako podstawa prawna oceny nowej żywności. To rozporządzenie zostało uchylone i zastąpione rozporządzeniem (UE) 2015/2283, na podstawie którego utworzono obecną unijną listę [5]. System automatycznie pobierający podstawę prawną z tego pola wprowadzi uchylony akt do dokumentu zgodności. Obowiązującymi tekstami dla tej substancji są obecnie rozporządzenie ramowe z 2015 roku i rozporządzenie wykonawcze z 2017 roku, które zawiera specyfikację.
| Hasło ostrzegawcze | Uwaga |
|---|---|
| Zwroty wskazujące rodzaj zagrożenia | H315 (100%) — działa drażniąco na skórę; H319 (100%) — działa drażniąco na oczy; H335 (100%) — może powodować podrażnienie dróg oddechowych |
| Klasy zagrożenia | Działanie żrące/drażniące na skórę, kategoria 2; poważne uszkodzenie oczu/podrażnienie oczu, kategoria 2; toksyczność dla konkretnego narządu docelowego, narażenie jednorazowe, kategoria 3, podrażnienie dróg oddechowych |
| Zwroty wskazujące środki ostrożności | P261, P264, P264+P265, P271, P280, P302+P352, P304+P340, P305+P351+P338, P319, P321, P332+P317, P337+P317, P362+P364, P403+P233, P405, P501 |
| Podstawa | Dwa raporty firm, z dwóch powiadomień — cytowane z linii podsumowania zapisu w spisie |
| Klasyfikacja zharmonizowana | Brak. Brak wpisu w załączniku z klasyfikacją zharmonizowaną |
| Pole piktogramu | Puste w rekordzie. Nie uzupełniamy go na podstawie domniemania |
Trzy stuprocentowe wartości wymagają uważnego czytania, ponieważ czytelnik, który je zobaczy H315, 100% w rozsądny sposób wywnioskuje konsensus branżowy. Tutaj oznacza to dwa na dwa. Dwie firmy złożyły zgłoszenia i obie się zgodziły. Jest to druga najsłabsza podstawa, na jaką pozwala wykaz, i jest bardzo daleka od zagregowanej klasyfikacji powszechnie notyfikowanej przemysłowej substancji chemicznej.
Dwie dodatkowe uwagi należy dodać obok tego stwierdzenia. Po pierwsze, klasyfikacja ta jest niezharmonizowana, więc nie jest prawnie wiążąca nigdzie w Unii Europejskiej, a inny dostawca może legalnie sklasyfikować tę samą substancję inaczej. Po drugie, w rekordzie nie ma podanych żadnych wartości toksyczności ostrej — odpowiednie sekcje są odnośnikami do zewnętrznych tabel, które nie zawierają wartości w rekordzie, który czytamy. Klasyfikacja opiera się zatem na samozgłoszeniu, a dane badawcze leżące u podstaw nie są widoczne w rekordzie.
Wynika z tego dla praktycznej pracy nie beztroska, ale wręcz przeciwnie: traktujcie trzy stwierdzenia o podrażnieniu jako minimalne rozsądne założenie, a nie jako kompletny profil zagrożeń, oraz odnotujcie we własnej ocenie ryzyka, że klasyfikacja pochodzi z dwóch powiadomień i jest niezharmonizowana.
| Ochrona osobista | Rękawice nitrylowe, okulary ochronne, fartuch laboratoryjny. Ważenie należy przeprowadzać w dygestorium lub pod wyciągiem miejscowym. Odnotowana klasyfikacja dotyczy podrażnienia skóry, oczu i dróg oddechowych, dlatego głównymi zagrożeniami są pył unoszący się podczas ważenia oraz przeniesienie substancji z rąk do oczu |
|---|---|
| Ocena ryzyka | Należy wyraźnie odnotować, że klasyfikacja pochodzi z dwóch powiadomień i nie jest zharmonizowana (sekcja 12), oraz że w rekordzie związku nie jest widoczna żadna wartość toksyczności ostrej |
| Temperatura | Chłodny, zamknięty pojemnik. W publicznym rekordzie nie istnieją badania stabilności tego materiału, dlatego nie podajemy temperatury przechowywania tak, jakby została zwalidowana |
| Wilgotność | Przechowywać w suchym miejscu i traktować wodę jako problem ilościowy, a nie kwestię porządkową. Prawo europejskie dopuszcza do 5,0% straty przy suszeniu dla materiału zgodnego [5], co stanowi prawną tolerancję dla wody niestechiometrycznej, a nie określony hydrat. Nie istnieje żadne badanie higroskopijności tego związku w rejestrach, do których mamy dostęp, dlatego podajemy tolerancję, a nie szybkość wchłaniania |
| Stabilność roztworu | Mostek difosforanowy jest słabym punktem, a jego hydroliza daje kwas 5′-cytydylowy — zanieczyszczenie ograniczone w specyfikacji do 1,0% [5] i źródło fragmentu cytydynomonofosforanu przy m/z 304,04 w zdeponowanym widmie (sekcja 7). Przygotowywać roztwory świeże, przechowywać je w chłodzie i pamiętać, że 1% roztwór wodny sam jest kwaśny, o pH 2,5–3,5 |
| Przygotowanie roztworu | Woda jest rozsądnym pierwszym wyborem ze względu na logP −4. W żadnym rejestrze nie ma liczbowej rozpuszczalności; należy ją oznaczyć na własnym materiale i zanotować temperaturę |
| Postać stała | Opisana w prawie jako biały krystaliczny proszek [5] i potwierdzona przez historyczną krystalizację [15] oraz strukturę pojedynczego kryształu [14]. Nie istnieją publicznie dostępne dane dyfrakcji proszkowej ani badania polimorficzne; jeśli Państwa praca zależy od formy stałej, to określenie jej należy do Państwa |
| Odpady | Odpady chemiczne organiczne bezhalogenowe, zgodnie z lokalnymi przepisami. Nie uwalniać do kanalizacji |
| Dokumentacja | Zarchiwizuj każde zarejestrowane widmo — szczególnie widmo 31P, 1H lub widmo w podczerwieni. Żadne z tych trzech nie jest publicznie dostępne dla tego związku, więc Twoje ma wartość wykraczającą poza Twoje własne laboratorium |
Trzy odrębne czynniki stoją pomiędzy odczytem na wadze a liczbą moli dla tej substancji, i one się kumulują.
| Założenie | Ilość substancji | W odniesieniu do wartości nominalnej |
|---|---|---|
| Sól wewnętrzna, bezwodna, 100% czystości (nominalnie) | 1000 / 488,32 = 2,048 mmol | — |
| Zamiast soli wewnętrznej - sól sodowa | 1000 / 510,31 = 1,960 mmol | O 4,3% mniej |
| Sól wewnętrzna w granicach prawnych: strata przy suszeniu 5,0%, zawartość 98% suchej masy [5] | 1000 × 0,95 × 0,98 = 931 mg → 1,907 mmol | O 6,9% mniej |
| Sól sodowa i w granicach prawnych | 1,824 mmol | O 10,9% mniej |
Celem tej tabeli nie jest to, że konkretna partia znajduje się w najgorszym przypadku. Chodzi o to, że wartość czystości podana bez określenia podstawy nie jest specyfikacją. "Dziewięćdziesiąt dziewięć procent" oznacza jedno w stanie dostarczonym, a co innego w przeliczeniu na suchą masę, i dla związku, którego specyfikacja prawna jest napisana jednoznacznie w przeliczeniu na suchą masę z osobną tolerancją na wodę obok, różnica nie jest czysto teoretyczna. Poproś o podstawę oznaczenia i zawartość wody w dokumentacji partii, a następnie oblicz na tej podstawie.
Jest to łagodniejsza wersja problemu, który powtarza się w przypadku materiałów odniesienia polarnych i tworzących sole. Dla alpha-GPC ta sama kwestia jest zdominowana przez higroskopijność, ponieważ ten związek pochłania wodę podczas ważenia. W przypadku cytykoliny zawartość wody jest ograniczona limitem prawnym, a nie zmierzonym tempem pochłaniania — co jest lepszą sytuacją, ale tylko wtedy, gdy liczba na świadectwie mówi, gdzie w tych granicach znajduje się Twoja partia.
| Twierdzenie | Status |
|---|---|
| Tożsamość chemiczna: numer CAS, wzór, masa molowa i monoizotopowa, InChI, InChIKey, liczba stereodeskryptorów | Cytowane z dwóch niezależnych źródeł, które się zgadzają — rejestr substancji [1] i tekst europejskiego rozporządzenia wykonawczego [5]. a nie jedno źródło zacytowane dwukrotnie |
| Rozróżnienie między solą wewnętrzną a solą sodową | Oba rekordy cytowane w całości z ich własnymi identyfikatorami [1][2]; różnica masy jest wynikiem arytmetycznego obliczenia na podstawie tych dwóch rekordów |
| Niemal identyczne rekordy w sekcji 3 | Każdy zidentyfikowany za pomocą własnego wpisu rejestrowego [3][4] z podanym InChIKey, aby czytelnik mógł samodzielnie sprawdzić różnicę |
| Brak danych NMR, podczerwieni, Ramana i ultrafioletu | Ustalenie dotyczące rekordu, a nie wynik niepełnego wyszukiwania — ustalone na podstawie odczytu całej sekcji widmowej [1] |
| Stwierdzenia regulacyjne w sekcji 11 | Zmierzone względem wskazanych dokumentów [5][9][10][11][12]; każdemu wynikowi negatywnemu towarzyszy kontrola pozytywna, która dała trafienie w tym samym dokumencie |
| Dane specyfikacji w sekcji 7 | Cytowane z tekstu Dziennika Urzędowego [5]. Prawo żywnościowe, nie prawo farmakopealne — zobacz zastrzeżenie na końcu tej sekcji |
| Przypisania fragmentów w sekcji 7 | Nasza interpretacja zdeponowanych mas [13], zgodna ze składem, nie cytat z opublikowanego badania fragmentacji |
| Sugestie metod w sekcji 6 | Punkty wyjścia, a nie zwalidowane procedury. Nie znaleziono w zindeksowanej literaturze żadnej zwalidowanej samodzielnej metody dla tej substancji |
| Temperatura topnienia, temperatura wrzenia, gęstość, rozpuszczalność, stała dysocjacji kwasowej, skręcalność właściwa | Niecertyfikowane — w żadnym dostępnym nam rejestrze nie ma wartości doświadczalnej. Jedyny artykuł poświęcony fizykochemii związku nie posiada identyfikatora cyfrowego i nie udało się go przeczytać [16] |
| Higroskopijność | Bez certyfikacji. Nie istnieje żadne badanie. Istnieje natomiast prawna tolerancja na straty podczas suszenia [5], co jest innym rodzajem stwierdzenia |
| Polimorfizm, wielkość cząstek, zawartość wody partii | Niecertyfikowane w treści katalogu. Brak publicznie dostępnego badania polimorficznego dla tej substancji |
| Wartość czystości dla dostarczonej partii | Nie deklarujemy w opisie katalogowym. Podane w dokumentacji partii razem z metodą oraz, specyficznie dla tej substancji, podstawą — w stanie dostarczonym lub w przeliczeniu na suchą masę — i zawartością wody |
| Droga wytwarzania dostarczonej partii | Nie stwierdza się tutaj. Prawo europejskie dopuszcza zarówno drogę syntetyczną, jak i fermentacyjną o identycznych głównych specyfikacjach [5], a profile śladowe różnią się między nimi; jeśli droga ma znaczenie dla Państwa pracy, prosimy zapytać o nią na piśmie |
| Identyfikatory spoza głównego rejestru | Identyfikator z bazy danych metabolitów dla tego związku krąży za pośrednictwem źródła wtórnego; nie występuje w rekordzie związku i nie mogliśmy go potwierdzić u źródła, dlatego nie podajemy go jako faktu |
| Deklaracje farmakologiczne lub żywieniowe | Nie sformułowano żadnych. Sekcja 10 opisuje literaturę naukową; jest to opis literatury, a nie właściwość tego produktu. W europejskiej opinii naukowej z 2024 roku dotyczącej oświadczenia zdrowotnego związanego z pamięcią stwierdzono, że nie ustalono związku przyczynowo-skutkowego [7], a takie oświadczenie nie pojawia się nigdzie na tej stronie |
Ten materiał jest dostarczany jako odczynnik laboratoryjny i analityczny materiał odniesienia, przeznaczony wyłącznie do laboratoryjnych badań in vitro przez wykwalifikowany personel w odpowiednio wyposażonym obiekcie. Nie jest to produkt leczniczy, suplement diety, żywność, pasza ani składnik kosmetyków, nie jest wprowadzany na rynek jako nowa żywność i nie jest dostarczany do stosowania u ludzi lub zwierząt w jakiejkolwiek postaci ani jakąkolwiek drogą.
Składając zamówienie, kupujący potwierdza, że jest profesjonalnym użytkownikiem nabywającym materiał do celów laboratoryjnych; że będzie się z nim obchodzić zgodnie z sekcją 13 oraz własną oceną ryzyka instytucjonalnego; że nie poda go ludziom ani zwierzętom, ani nie dostarczy go osobie, która zamierza to zrobić; oraz że jest odpowiedzialny za przestrzeganie wszystkich przepisów prawa obowiązujących w miejscu przeznaczenia. Ten ostatni punkt ma szczególne znaczenie w przypadku tej substancji, ponieważ jest ona zatwierdzonym lekiem w niektórych jurysdykcjach, dozwolonym składnikiem żywności podlegającym ograniczeniom ilościowym w Unii Europejskiej oraz nierejestrowaną substancją chemiczną w Polsce — trzy reżimy prawne dla jednej cząsteczki.
Każda jednostka jest dostarczana z dokumentacją partii. Sekcja 14 precyzyjnie określa, jakie stwierdzenia obejmuje ta dokumentacja, a jakich nie obejmuje. Ogólne warunki mające zastosowanie do tego i każdego innego materiału odniesienia w ofercie są zebrane w kategorii wzorców analitycznych.
Nic na tej stronie nie stanowi porady medycznej ani żywieniowej, ani oferty produktu leczniczego lub żywności. Stwierdzenia w sekcjach 10 i 11 opisują opublikowane badania i status regulacyjny substancji w różnych jurysdykcjach; nie opisują one tego produktu ani żadnego sposobu jego użycia.
-UHFFFAOYSA-N zamiast -OJAKKHQRSA-N [3]. Jest to ta sama konektywność narysowana bez stereochemii i zgłasza 0 zdefiniowanych / 4 niezdefiniowane. Wzór i dokładna masa nie mogą odróżnić tych dwóch rekordów; tylko pełny InChIKey może.